非婚生子有出生证明，上男方户口时仍要求做亲子鉴定，通常有以下几方面原因：

    从防止人口管理漏洞角度

    避免虚假出生证明 ：现实中存在一些不法分子为了达到给孩子落户等目的，会伪造出生证明。要求进行亲子鉴定可以更准确地确认孩子与男方之间的生物学亲子关系，从而防止利用虚假出生证明违规落户的情况发生，维护户籍管理的准确性和严肃性。

    防止冒名顶替 ：可能存在他人冒用男方身份信息为孩子办理出生证明，企图将孩子落户到男方名下的情况。通过亲子鉴定能有效识别这种冒名顶替行为，保障男方的合法权益，也确保户籍信息的真实可靠。

    从法律规定和权益保障角度

    明确法律亲子关系 ：在非婚生育的情况下，仅凭借出生证明不能完全确定男方与孩子的法律亲子关系。出生证明虽然记录了孩子的出生信息和父母信息，但在法律上，需要通过亲子鉴定这样科学的手段来进一步明确亲子关系，以便在涉及抚养权、继承权等诸多法律权益问题时，能够有准确的依据。

    保障男方知情权和选择权 ：进行亲子鉴定可以让男方在法律层面真正确认自己与孩子的亲子关系。这是对男方知情权的保障，使其能够在清楚知晓亲子关系的基础上，行使相应的权利和履行义务。例如，如果男方对亲子关系存在疑问，亲子鉴定结果可以帮助他做出正确的决策。

    从社会公平和资源分配角度

    确保资源合理分配 ：孩子落户后会涉及到社会福利、教育资源等一系列公共资源的分配。准确确认亲子关系可以保证这些资源能够合理地分配到真正需要的家庭和孩子身上，避免因错误的户籍登记导致资源分配不公的情况发生。

   如果你对做亲子鉴定的要求存在疑问，可以向当地户籍管理部门详细咨询具体的政策依据和操作流程。