非婚生子持出生证明上男方户口时被要求做亲子鉴定，通常有以下几方面原因：

    防止虚假申报户口

   在非婚生育的情况下，可能存在一些人出于各种目的，如获取拆迁补偿、为他人孩子违规落户等，故意提供虚假的出生证明来为孩子申报户口。通过亲子鉴定，可以准确确定孩子与男方之间是否存在生物学上的父子关系，从而有效防止虚假申报户口的情况发生，确保户籍信息的真实性和准确性。

    出生证明存在瑕疵或无法证明亲子关系

   虽然出生证明是孩子出生的重要凭证，但在非婚生育场景中，出生证明可能存在一些问题，导致其不足以直接证明孩子与男方的亲子关系：

    信息不完整或不准确 ：出生证明上可能没有准确填写父亲的信息，或者填写的信息与实际情况不符。例如，父亲的姓名、身份证号等关键信息有误，这种情况下，仅依靠出生证明无法明确孩子与申报户口的男方之间的亲子关系，所以需要进行亲子鉴定来确认。

    出生证明来源存疑 ：如果出生证明的开具过程存在不规范之处，或者有迹象表明出生证明可能是伪造、变造的，户籍管理部门为了谨慎起见，会要求通过亲子鉴定来进一步核实亲子关系。

    遵循户籍管理规定

   不同地区的户籍管理政策可能存在差异，但为了规范户籍管理，保障公民合法权益，很多地方都对非婚生子女落户做出了严格规定。要求进行亲子鉴定是其中的一项常见要求，目的是确保孩子能够准确地登记在其生物学父亲的户籍下，避免户籍管理混乱。

   如果遇到这种情况，你应积极配合进行亲子鉴定。在选择鉴定机构时，要选择具有资质的正规机构，以确保鉴定结果的准确性和合法性。之后凭借亲子鉴定报告等相关材料，按户籍部门要求办理孩子落户手续。