非婚生子有出生证明但上男方户口时还要求做亲子鉴定，通常是基于以下几方面原因：

    防止户籍登记错误

   1. 确认亲子关系的真实性

   出生证明虽然是孩子出生的重要凭证，但它本身并不能完全排除错误或虚假的情况。在非婚生育的情况下，没有婚姻关系的约束和证明，可能存在一些特殊情况导致出生证明上登记的父亲信息不准确。例如，母亲可能因各种原因误将他人登记为孩子的父亲，或者存在故意冒用他人身份登记父亲信息的情况。通过亲子鉴定可以准确确定孩子与男方之间的生物学亲子关系，确保户籍登记的准确性。

   2. 避免人口管理漏洞

   严格的户籍登记制度要求准确核实亲子关系，以防止出现非法落户、冒用身份等问题。如果仅依据出生证明就为孩子办理上户，可能会被不法分子利用，造成人口管理的混乱。亲子鉴定作为一种科学的鉴定方法，可以有效避免此类漏洞，保障户籍信息的真实性和可靠性。

    保障男方及其他相关方权益

   1. 保护男方合法权益

   对于男方来说，亲子鉴定可以确保他确实是孩子的生物学父亲。在非婚生育的情况下，男方可能对亲子关系存在疑虑，亲子鉴定可以为他提供明确的结果，避免在不知情的情况下承担不属于自己的抚养责任。同时，如果男方希望通过法律途径确认自己对孩子的权利，如抚养权、探视权等，亲子鉴定结果也是重要的证据。

   2. 维护其他相关方权益

   亲子鉴定也有助于维护其他可能涉及的相关方的权益，例如男方的配偶、其他家庭成员等。如果男方在不知情的情况下为他人的孩子上户，可能会对其家庭关系和财产权益产生影响。通过亲子鉴定，可以避免这种潜在的纠纷，保障各方的合法权益。

    遵循法律法规和政策要求

   不同地区的户籍管理政策可能有所不同，但总体上，为了规范户籍登记、保障人口信息的准确性和合法性，很多地方都要求非婚生子女上男方户口时提供亲子鉴定证明。这是遵循国家相关法律法规和地方政策的具体体现，以确保户籍管理工作的严谨性和公正性。

   总之，虽然有出生证明，但亲子鉴定作为一种科学、准确的亲子关系鉴定方法，可以为非婚生子上男方户口提供更可靠的依据，保障各方的合法权益和户籍管理的规范有序。