非婚生子有出生证明的情况下，上男方户口还要做亲子鉴定，主要有以下几方面原因：

    防止户籍管理漏洞

    避免冒名登记 ：在非婚生育的情况下，可能存在一些人为了各种目的（如获取拆迁补偿、上学指标等），利用虚假的出生证明将孩子登记到男方户口上。通过亲子鉴定，可以准确确认孩子与男方之间是否存在生物学上的亲子关系，防止他人冒用身份信息进行户籍登记，维护户籍管理制度的严肃性和准确性。

    杜绝拐卖儿童入户 ：不法分子可能会利用非婚生育的特殊情况，试图通过虚假的出生证明将拐卖的儿童登记到他人户口上。亲子鉴定是一种有效的防范手段，能够从源头上避免拐卖儿童通过非法途径获得合法身份，保障儿童的合法权益和社会的公平正义。

    明确法律责任和权益

    保障男方权益 ：对于男方来说，通过亲子鉴定可以确认孩子是否为自己亲生。在涉及到抚养权、抚养费、财产继承等问题时，明确的亲子关系是确定男方权利和义务的重要依据。如果没有经过亲子鉴定就直接上户口，可能会导致男方在不知情的情况下承担不必要的法律责任。

    维护社会公平 ：在社会资源分配和法律执行过程中，准确的亲子关系认定至关重要。例如，在涉及社会福利、遗产继承等方面，只有确定了真实的亲子关系，才能保证资源的合理分配和法律的正确实施，避免因虚假亲子关系导致的不公平现象。

    符合户籍政策要求

    政策规定 ：不同地区的户籍管理政策可能会有所差异，但总体上，为了规范户籍管理，防止人口信息错误和虚假登记，许多地方都要求非婚生育的子女上男方户口时提供亲子鉴定证明。这是为了确保户籍信息的真实性和可靠性，便于政府进行人口统计和管理。

   虽然有出生证明，但出生证明本身只能证明孩子的出生事实和基本信息，不能直接证明亲子关系的真实性。亲子鉴定是一种科学、准确的方法，可以为户籍登记提供更可靠的依据。