非婚生子有出生证明但上男方户口时仍要求做亲子鉴定，主要有以下几方面原因：

    确认亲子关系

    出生证明仅为初步证据 ：出生证明是孩子出生情况的基本记录，但在非婚生育的情况下，其证明力相对有限。出生证明上登记的父亲信息可能只是母亲单方面提供的，没有经过严格的亲子关系确认程序。相关部门为了准确确定孩子与男方之间的生物学亲子关系，避免错误登记户口，要求进行亲子鉴定。

    防止冒认或误认 ：社会生活中存在一些出于各种目的冒认亲子关系的现象。比如为了获得拆迁补偿、福利等利益，有人可能会试图将非亲生子女登记在自己户口下。通过亲子鉴定，可以有效防止这种冒认行为，确保户口登记的准确性和公正性。

    遵循户籍管理规定

    确保户籍信息真实准确 ：户籍管理是国家行政管理的重要组成部分，要求户籍信息必须真实、准确、完整。对于非婚生子女上男方户口这种情况，需要更严格的审核机制。亲子鉴定是一种科学、准确的确认亲子关系的方法，通过这种方式能保证户籍信息中亲属关系的真实性，维护户籍管理秩序。

    符合法律程序要求 ：在户籍登记相关法律法规和政策中，对于非婚生子女的户口登记有明确规定，以保证人口信息的合法性和规范性。进行亲子鉴定是遵循这些规定和程序的必要步骤，能避免因亲子关系不明导致的后续法律纠纷和管理难题。

    保障各方权益

    保障孩子权益 ：通过亲子鉴定准确确定亲子关系后，孩子可以依法享有与婚生子女同等的权利，如获得抚养、教育、继承等权益。这有助于保障孩子在法律上的合法地位，为其成长和发展提供稳定的法律保障。

    保障男方权益 ：对于男方而言，亲子鉴定也能保障其合法权益。只有通过科学的鉴定确认亲子关系，男方才需要承担相应的抚养义务等责任，避免被错误地要求承担不属于自己的责任。同时，这也可以让男方在确认亲子关系后，更好地履行对孩子的义务和行使相关权利。