非婚生子有出生证明但上男方户口时仍要求做亲子鉴定，主要有以下几方面原因：

    防止户籍管理漏洞

   在户籍管理过程中，需要确保户口登记信息的准确性和真实性。非婚生育的情况下，可能存在一些特殊情况，比如出生证明可能存在虚假开具、信息错误等问题。

   - 虽然出生证明是孩子出生的重要凭证，但它本身存在被伪造、篡改的可能性。通过亲子鉴定，可以进一步核实孩子与申报户口的男方之间的生物学亲子关系，避免有人利用虚假的出生证明为他人子女违规落户，保障户籍登记的准确性和权威性，维护正常的户籍管理秩序。

    保障男方权益

   从男方的角度来看，亲子鉴定是对其合法权益的一种保障。

   - 在非婚生育的情形下，可能存在一些复杂的情况，比如女方可能误认或故意错误指认孩子的生父。通过亲子鉴定，男方可以明确自己与孩子之间是否存在生物学上的亲子关系，避免承担不必要的抚养责任。同时，对于确实是自己亲生子女的情况，也能通过合法的程序将孩子户口上到自己名下，保障孩子的合法权益。

    遵循法律规定和政策要求

   根据相关的户籍管理规定和政策，对于非婚生育子女落户的情况，为了明确亲子关系，往往要求提供亲子鉴定证明。

   - 不同地区的户籍政策可能会有所差异，但总体上都是为了规范户口登记行为，防止出现人口管理混乱等问题。例如，有些地方规定非婚生子女随父落户时，除了出生证明外，还需要提供具有资质的鉴定机构出具的亲子鉴定证明，以确保孩子与父亲之间的亲子关系得到科学、准确的认定。