非婚生子有出生证明但上男方户口仍需亲子鉴定，主要有以下几方面原因：

    从户籍管理规范角度

    防止户籍造假 ：虽然出生证明是孩子出生情况的一种证明文件，但在非婚生育的情况下，存在出生证明信息不实或被伪造的可能性。比如，可能有人为了让孩子获得更好的落户条件，故意提供虚假的出生证明。通过亲子鉴定可以从生物学角度准确确定亲子关系，有效防止虚假户籍信息的录入，维护户籍管理的严肃性和准确性。

    明确法定亲子关系 ：在婚姻关系中，孩子的亲子关系一般基于婚姻事实可以较为明确认定。但非婚生育时，仅依据出生证明不能确凿证明孩子与男方的亲子关系。户籍登记需要明确的法定亲子关系证明，亲子鉴定结果具有权威性和法律效力，能够为户籍登记提供可靠的依据，确保孩子合法地登记在男方户籍下。

    从保护当事人权益角度

    保障男方合法权益 ：要求进行亲子鉴定可以避免他人恶意将孩子的户口登记在男方名下，给男方带来不必要的法律责任和经济负担。例如，如果孩子并非男方亲生，却错误地登记在男方户口下，可能会涉及到未来的抚养、继承等一系列问题。通过亲子鉴定，男方可以确认自己与孩子的真实关系，保护自己的合法权益。

    保障孩子合法权益 ：对于孩子来说，准确的户籍登记关系到其未来的教育、医疗、社会保障等诸多权益。通过亲子鉴定确定与男方的亲子关系，能使孩子以合法、准确的身份融入家庭和社会，享受应有的权益和福利。比如，在一些地区，孩子入学需要提供准确的户籍信息和亲子关系证明。