非婚生子有出生证明，上男方户口时要求做亲子鉴定，通常有以下几方面原因：

    防止户籍管理漏洞

    避免虚假出生证明 ：虽然出生证明是孩子出生的重要凭证，但在现实中，存在不法分子伪造、变造出生证明的情况。通过亲子鉴定，可以进一步核实孩子与男方之间的生物学亲子关系，防止有人利用虚假出生证明为孩子违规落户，维护户籍管理的严肃性和准确性。

    打击非法代孕等违法行为 ：非婚生育的情况相对复杂，可能涉及代孕等违法情形。亲子鉴定能够从生物学角度确定亲子关系，有助于相关部门打击非法代孕等违法活动，保障人口管理和社会秩序的正常运行。

    明确亲子关系以保障权益

    保障男方合法权益 ：对于男方来说，通过亲子鉴定可以确定孩子确实是自己亲生的，避免在不知情的情况下承担非亲生子女的抚养等责任。同时，也能确保男方及其家庭的财产等权益能够合理传承给真正的直系血亲。

    保障孩子合法权益 ：准确的亲子关系认定，能让孩子在法律上获得与婚生子女同等的权益，如获得男方的抚养、教育费用，享有男方家族的继承权等。在后续涉及医疗、保险等方面，明确的亲子关系也能保障孩子顺利享受相应权益。

    遵循户籍登记政策要求

    各地政策差异 ：不同地区的户籍登记政策可能存在一定差异。有些地方为了规范非婚生子女的落户程序，统一要求提供亲子鉴定证明，以确保落户信息的真实性和准确性。即使有出生证明，也不能完全替代亲子鉴定在确定亲子关系上的权威性。

   如果遇到这种情况，你可以按照当地户籍管理部门的要求进行亲子鉴定，并准备好相关材料办理落户手续。同时，若对政策存在疑问，也可以向户籍管理部门咨询了解具体规定和依据。