以下分别对互不追究协议的效力以及甲方拖欠工资的问题进行分析：

    互不追究协议的效力

   1. 一般情形下可能存在效力瑕疵

   双方签订的“互不追究”协议通常属于民事合同性质。然而，如果该协议是在甲方以不帮乙方办理退休手续为要挟，迫使乙方签订的，那么这种协议可能因存在胁迫情形而可被撤销。

   根据《中华人民共和国民法典》第一百五十条规定，一方或者第三人以胁迫手段，使对方在违背真实意思的情况下实施的民事法律行为，受胁迫方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。办理退休手续是甲方基于劳动关系等可能负有的法定义务，甲方不能以不履行法定义务为手段来迫使乙方签订所谓的互不追究协议。

   2. 违反法律法规强制性规定的无效

   退休手续的办理涉及劳动者的基本权益以及国家退休制度的管理，有一系列的法律法规进行规范。如果该“互不追究”协议的内容违反了关于退休手续办理、劳动者权益保障等相关法律法规的强制性规定，那么该协议会被认定为无效。例如，协议约定乙方放弃追究甲方不为其办理退休手续导致的所有损失，而这种约定排除了乙方依据法律应享有的合法权益，应属无效条款。

    甲方拖欠乙方工资的问题

   1. 甲方行为违法

   根据《中华人民共和国劳动法》第五十条规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。甲方拖欠乙方工资的行为明显违反了这一法律规定，乙方有权要求甲方支付拖欠的工资。

   2. 乙方的维权途径

    协商解决 ：乙方可以先与甲方进行沟通协商，要求甲方支付拖欠的工资并按照规定办理退休手续。

    劳动监察投诉 ：乙方可以向当地的劳动监察部门投诉，劳动监察部门有权对用人单位进行监督检查，并责令其支付拖欠的工资。

    劳动仲裁 ：如果协商和投诉都无法解决问题，乙方可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。仲裁是解决劳动争议的重要途径，仲裁裁决具有法律效力，甲方应当履行。

    诉讼 ：如果乙方对仲裁结果不服，还可以向人民法院提起诉讼。

   综上所述，双方签订的互不追究协议可能因胁迫或违反法律法规强制性规定而无效或可撤销，甲方拖欠工资的行为违法，乙方可以通过多种途径维护自己的合法权益。