以下为你分析你面临的情况以及可以采取的应对措施：

    关于工资支付时间的问题

   虽然离职证明未明确工资支付时间，但离职协议中有相关约定且一式两份。这种情况下，该离职协议是具有法律效力的，如果公司没有按照离职协议约定的时间支付工资，你可以采取以下步骤维权：

   1. 与公司沟通 ：首先尝试与公司人力资源部门或者你的上级领导联系，提醒他们按照离职协议的约定支付工资。沟通时注意保留好聊天记录、通话录音等证据，以备后续可能出现的纠纷。

   2. 寻求劳动监察部门帮助 ：如果与公司沟通后仍未得到解决，你可以向当地的劳动监察部门投诉。你需要准备好能够证明你与公司存在劳动关系、工资标准以及离职协议约定内容的相关材料，如劳动合同、工资条、离职协议等。劳动监察部门会根据你提供的信息对公司进行调查，并责令公司支付拖欠的工资。

   3. 申请劳动仲裁 ：若劳动监察部门无法解决问题，你可以向当地的劳动仲裁委员会申请劳动仲裁。劳动仲裁是一种比较常见的解决劳动纠纷的方式，一般需要提交仲裁申请书、证据材料等。仲裁裁决具有法律效力，如果公司不履行仲裁裁决，你可以向法院申请强制执行。

    关于离职协议一式两份的问题

   正常情况下，离职协议一式两份，公司和你各执一份，这是为了保证双方都有协议的原件，以明确各自的权利和义务。如果你手中没有拿到属于自己的那份离职协议，你可以向公司索要：

    及时索要 ：尽快与公司相关负责人联系，说明你需要一份离职协议原件存档。一般来说，正规公司会配合你的要求。

    留存证据 ：如果公司拒绝提供，你可以通过邮件、短信等方式再次向公司提出索要请求，并保留好相关证据，证明你曾经向公司索要过离职协议。

   总之，你要重视离职协议中关于工资支付的约定，积极维护自己的合法权益。如果在处理过程中遇到困难，也可以考虑咨询专业的劳动法律师获取更详细的法律建议。