这种情况涉及到农村不动产证注销的合法性问题。下面为你分析并提供一些建议：

    法律规定

   根据相关法律政策，农村宅基地及房屋不动产登记遵循“房地一体”原则。一般情况下，虽然户口迁出农村，但如果原宅基地上的房屋是合法建造的，权利人依然享有房屋的所有权。

   依据《确定土地所有权和使用权的若干规定》第四十八条规定，非农业户口居民（含华侨）原在农村的宅基地，房屋产权没有变化的，可依法确定其集体土地建设用地使用权。房屋拆除后没有批准重建的，土地使用权由集体收回。

   也就是说，仅仅因为户口不在农村就注销不动产证，可能不符合法律规定。

    应对措施

    收集证据

   - 收集能证明你对该不动产拥有合法权益的证据，比如不动产证原件（若已被收回，可去相关部门调取登记档案）、建房审批手续、宅基地使用证明等。

   - 记录与职能部门沟通的情况，包括时间、地点、参与人员、谈话内容等，最好能有书面记录或者录音。

    再次沟通

   - 你可以再次前往职能部门，要求其提供注销不动产证的具体法律依据和详细理由，并要求出具书面的说明文件。

   - 在沟通时，向他们解释相关法律规定，强调户口迁出并不必然导致不动产证被注销。

    行政复议

   - 如果职能部门无法给出合理的解释和依据，你可以自知道该具体行政行为之日起六十日内提出行政复议申请。

   - 复议机关一般是作出注销决定的职能部门的上一级主管部门或者本级人民政府。申请复议时要提交复议申请书、你的身份证明、不动产证相关材料以及职能部门注销决定的相关材料等。

    行政诉讼

   - 如果行政复议没有达到预期效果，或者你对复议结果不满意，你可以在收到复议决定书之日起十五日内向人民法院提起行政诉讼；如果直接提起行政诉讼，应当自知道或者应当知道作出行政行为之日起六个月内提出。

   - 行政诉讼是通过司法途径来审查职能部门注销不动产证这一行政行为的合法性。在诉讼过程中，你需要向法院提供充分的证据来支持你的主张。