商铺改住房后办理房产证是否合法合规，需要分情况来看，以下是详细分析：

    合法合规的情况

    符合规划变更手续

    - 根据我国相关规定，如果业主或开发商想要将商铺用途变更为住宅用途，首先要经过规划部门的审批。规划部门会根据城市整体规划布局、用地性质等多方面因素进行评估。若变更符合城市规划要求，会出具同意变更的文件。

    - 例如，某城市老城区的一片商业区域，随着城市发展，周边居民增多，对住宅的需求增大，而该区域部分商铺经营不善，经综合评估，规划部门同意将部分商铺变更为住宅用途。

    完成土地性质变更及补缴出让金

    - 商铺和住宅所对应的土地使用性质和出让金标准不同。商铺一般是商业用地，住宅是住宅用地。在规划变更允许后，还需要到土地管理部门办理土地性质变更手续，并按照规定补缴土地出让金差价。

    - 比如，原来商业用地剩余使用年限还有30年，变更为住宅用地后，可能需要根据当时的土地市场价格和剩余使用年限等因素，补缴一定金额的出让金。完成这些手续后，办理房产证就是合法合规的。

    通过相关验收

    - 商铺改住房后，要通过一系列的验收，包括建筑质量验收、消防验收、环保验收等。以消防验收为例，住宅的消防标准和商铺不同，改造后的房屋必须满足住宅的消防要求，如配备合适的消防设施、设置合理的疏散通道等。只有各项验收都合格，才具备办理房产证的条件。

    不合法合规的情况

    未经规划审批擅自改造

    - 如果没有经过规划部门的批准，业主自行将商铺内部结构进行改造，改变其使用功能为住宅，这是违反规划管理规定的行为。这种情况下无法办理房产证，并且相关部门可能会责令恢复原状，并处以罚款。

    - 例如，某业主为了自住，在未申请规划变更的情况下，将自己的商铺隔成卧室、客厅等居住空间，这种私自改造是不被允许的。

    未完成土地性质变更

    - 即使进行了规划变更，但没有按照规定到土地管理部门办理土地性质变更手续和补缴出让金，也不能合法办理房产证。因为土地性质仍然是商业用地，与要办理的住宅房产证性质不符。

    验收不通过

    - 改造后的房屋如果在建筑质量、消防、环保等方面不符合住宅的相关标准和要求，无法通过验收，同样不能办理房产证。比如，改造后的房屋消防设施不符合住宅消防规范，存在严重的消防安全隐患，就不能获得房产证。