非农户口在农村建房被强拆是否违法，需要结合具体情况来判断，以下从合法强拆和违法强拆两方面进行分析：

    合法强拆的情况

    建房行为本身违法

    - 根据相关法律规定，农村宅基地通常是分配给本村集体经济组织成员的。非农户口人员一般不具备申请农村宅基地的资格。如果非农户口人员未经合法审批，擅自占用农村集体土地建房，这种建房行为本身就是违法的。

    - 例如，《土地管理法》规定，未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还非法占用的土地，对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状。在这种情况下，行政机关按照法定程序进行强拆，是合法的执法行为。

    遵循法定强拆程序

    - 即使建房行为违法，行政机关进行强拆也必须遵循法定程序。一般来说，行政机关要先进行调查认定，确认建房属于违法建筑，然后作出责令限期拆除的决定，并告知当事人享有的陈述、申辩等权利。如果当事人在规定期限内既不申请行政复议也不提起行政诉讼，又不自行拆除的，行政机关可以依法申请人民法院强制执行。例如，《行政强制法》对行政机关实施行政强制的程序有明确规定，行政机关按照这些程序进行的强拆是合法的。

    违法强拆的情况

    未履行法定程序

    - 如果行政机关在没有进行充分调查认定，未作出责令限期拆除决定，或者未告知当事人相关权利的情况下就直接进行强拆，属于程序违法。比如，在一些案例中，行政机关没有给当事人送达书面的拆除通知，就突然组织人员进行强拆，这种行为明显违反了法定程序，是违法的。

    超越法定职权

    - 不同级别的行政机关在处理违法建筑时有不同的权限规定。如果某个行政机关超越了自己的职权范围进行强拆，也是违法的。例如，一些乡镇政府没有得到法律授权，擅自对非农户口在农村的房屋进行强拆，就属于超越职权的违法行为。

    滥用职权

    - 行政机关在强拆过程中，如果存在滥用职权的情况，如为了达到某些不正当目的而故意对合法或轻微违法的建筑进行强拆，也是违法的。比如，为了推进某个项目建设，在没有充分证据证明房屋违法的情况下就强行拆除，这就是滥用职权的表现。